审查起诉阶段人民检察院自行补充侦查，主要适用于以下情形（）。

审查起诉阶段人民检察院自行补充侦查，主要适用于以下情形（）。
主要的犯罪事实、情节不清，证据不足
侦查机关侦查活动有违法情形
人民检察院在事实和证据认定上与侦查机关有较大分歧
案件已经过退查仍未查清
基本犯罪事实、情节不清，证据不足
正确答案：侦查机关侦查活动有违法情形
人民检察院在事实和证据认定上与侦查机关有较大分歧
案件已经过退查仍未查清